run 5.97 KB
Newer Older
spiasko's avatar
spiasko committed
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
#!/bin/bash --login
#SBATCH --job-name="TASK_4"
#SBATCH --nodes=1 # the number of ranks (total)
#SBATCH --ntasks-per-node=12 # the number of ranks per node
##SBATCH --ntasks-per-core=1 # enable this if you want hyperthreading
#SBATCH --cpus-per-task=1 # use this for threaded applications
#SBATCH --time=00:20:00
#SBATCH --constraint=gpu
#SBATCH --account=s904
##SBATCH --partition=normal
#SBATCH --output="c1"


module load daint-gpu
export CRAY_CUDA_MPS=1
module load QuantumESPRESSO/6.3-CrayIntel-18.08
a=15
alat=`echo "${a} / 0.529177" | bc -l`

cat >pw.in << EOF
 &control
    verbosity='high'
    calculation='scf'
    restart_mode='from_scratch'
    prefix='SI'
    pseudo_dir = './',
    outdir='./'
    wf_collect=.true.
 /
 &system
    ibrav=2
    celldm(1)=${alat}
    nat=2,
    ntyp=1,
    ecutwfc = 30,
    occupations='smearing',
    degauss=0.001
 /
 &electrons
    conv_thr = 1.0e-8
    mixing_beta = 0.5
 /
 &ions
 /
ATOMIC_SPECIES
  Si  28.086  Si.pbe-mt_fhi.UPF
ATOMIC_POSITIONS  crystal
 Si 0.00 0.00 0.00
 Si 0.25 0.25 0.25
K_POINTS automatic
8 8 8 1 1 1
EOF

srun -n $SLURM_NTASKS --ntasks-per-node=$SLURM_NTASKS_PER_NODE -c $SLURM_CPUS_PER_TASK --cpu_bind=rank --hint=nomultithread  pw.x <pw.in > si.out

cat >pwb.in << EOF2
 &control
    verbosity='high'
    calculation='bands'
    restart_mode='from_scratch'
    prefix='SI'
    pseudo_dir = './',
    outdir='./'
    wf_collect=.true.
 /
 &system
    ibrav=2
    celldm(1)=${alat}
    nat=2,
    ntyp=1,
    ecutwfc = 30,
    occupations='smearing',
    degauss=0.001
 /
 &electrons
    conv_thr = 1.0e-8
    mixing_beta = 0.5
 /
 &ions
 /
ATOMIC_SPECIES
  Si  28.086  Si.pbe-mt_fhi.UPF
ATOMIC_POSITIONS  angstrom
 Si 0.00 0.00 0.00
 Si 0.25 0.25 0.25
K_POINTS crystal
 100
  0.5         0.5         0.5           1
  0.48888889  0.48888889  0.48888889    1
  0.47777778  0.47777778  0.47777778    1
  0.46666667  0.46666667  0.46666667    1
  0.45555556  0.45555556  0.45555556    1
  0.44444444  0.44444444  0.44444444    1
  0.43333333  0.43333333  0.43333333    1
  0.42222222  0.42222222  0.42222222    1
  0.41111111  0.41111111  0.41111111    1
  0.4         0.4         0.4           1
  0.38888889  0.38888889  0.38888889    1
  0.37777778  0.37777778  0.37777778    1
  0.36666667  0.36666667  0.36666667    1
  0.35555556  0.35555556  0.35555556    1
  0.34444444  0.34444444  0.34444444    1
  0.33333333  0.33333333  0.33333333    1
  0.32222222  0.32222222  0.32222222    1
  0.31111111  0.31111111  0.31111111    1
  0.3         0.3         0.3           1
  0.28888889  0.28888889  0.28888889    1
  0.27777778  0.27777778  0.27777778    1
  0.26666667  0.26666667  0.26666667    1
  0.25555556  0.25555556  0.25555556    1
  0.24444444  0.24444444  0.24444444    1
  0.23333333  0.23333333  0.23333333    1
  0.22222222  0.22222222  0.22222222    1
  0.21111111  0.21111111  0.21111111    1
  0.2         0.2         0.2           1
  0.18888889  0.18888889  0.18888889    1
  0.17777778  0.17777778  0.17777778    1
  0.16666667  0.16666667  0.16666667    1
  0.15555556  0.15555556  0.15555556    1
  0.14444444  0.14444444  0.14444444    1
  0.13333333  0.13333333  0.13333333    1
  0.12222222  0.12222222  0.12222222    1
  0.11111111  0.11111111  0.11111111    1
  0.1         0.1         0.1           1
  0.08888889  0.08888889  0.08888889    1
  0.07777778  0.07777778  0.07777778    1
  0.06666667  0.06666667  0.06666667    1
  0.05555556  0.05555556  0.05555556    1
  0.04444444  0.04444444  0.04444444    1
  0.03333333  0.03333333  0.03333333    1
  0.02222222  0.02222222  0.02222222    1
  0.01111111  0.01111111  0.01111111    1
  0.          0.          0.            1
  0.00925926  0.          0.00925926    1
  0.01851852  0.          0.01851852    1
  0.02777778  0.          0.02777778    1
  0.03703704  0.          0.03703704    1
  0.0462963   0.          0.0462963     1
  0.05555556  0.          0.05555556    1
  0.06481481  0.          0.06481481    1
  0.07407407  0.          0.07407407    1
  0.08333333  0.          0.08333333    1
  0.09259259  0.          0.09259259    1
  0.10185185  0.          0.10185185    1
  0.11111111  0.          0.11111111    1
  0.12037037  0.          0.12037037    1
  0.12962963  0.          0.12962963    1
  0.13888889  0.          0.13888889    1
  0.14814815  0.          0.14814815    1
  0.15740741  0.          0.15740741    1
  0.16666667  0.          0.16666667    1
  0.17592593  0.          0.17592593    1
  0.18518519  0.          0.18518519    1
  0.19444444  0.          0.19444444    1
  0.2037037   0.          0.2037037     1
  0.21296296  0.          0.21296296    1
  0.22222222  0.          0.22222222    1
  0.23148148  0.          0.23148148    1
  0.24074074  0.          0.24074074    1
  0.25        0.          0.25          1
  0.25925926  0.          0.25925926    1
  0.26851852  0.          0.26851852    1
  0.27777778  0.          0.27777778    1
  0.28703704  0.          0.28703704    1
  0.2962963   0.          0.2962963     1
  0.30555556  0.          0.30555556    1
  0.31481481  0.          0.31481481    1
  0.32407407  0.          0.32407407    1
  0.33333333  0.          0.33333333    1
  0.34259259  0.          0.34259259    1
  0.35185185  0.          0.35185185    1
  0.36111111  0.          0.36111111    1
  0.37037037  0.          0.37037037    1
  0.37962963  0.          0.37962963    1
  0.38888889  0.          0.38888889    1
  0.39814815  0.          0.39814815    1
  0.40740741  0.          0.40740741    1
  0.41666667  0.          0.41666667    1
  0.42592593  0.          0.42592593    1
  0.43518519  0.          0.43518519    1
  0.44444444  0.          0.44444444    1
  0.4537037   0.          0.4537037     1
  0.46296296  0.          0.46296296    1
  0.47222222  0.          0.47222222    1
  0.48148148  0.          0.48148148    1
  0.49074074  0.          0.49074074    1
  0.5         0.          0.5           1
EOF2
srun -n $SLURM_NTASKS --ntasks-per-node=$SLURM_NTASKS_PER_NODE -c $SLURM_CPUS_PER_TASK --cpu_bind=rank --hint=nomultithread  pw.x <pwb.in > sibands.out