run 9.61 KB
Newer Older
psd's avatar
psd committed
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
#!/bin/bash --login
#SBATCH --job-name="TASK_2"
#SBATCH --nodes=1 # the number of ranks (total)
#SBATCH --ntasks-per-node=12 # the number of ranks per node
##SBATCH --ntasks-per-core=1 # enable this if you want hyperthreading
#SBATCH --cpus-per-task=1 # use this for threaded applications
#SBATCH --time=00:20:00
#SBATCH --constraint=gpu
#SBATCH --account=YOUR_ACCOUNT
##SBATCH --partition=normal
#SBATCH --output="c1"


module load daint-gpu
export CRAY_CUDA_MPS=1
module load QuantumESPRESSO/6.3-CrayIntel-18.08
a=16.29
alat=`echo "${a} / 0.529177" | bc -l`

cat >pw.in << EOF
 &control
    verbosity='high'
    calculation='scf'
    restart_mode='from_scratch'
    prefix='SI'
    pseudo_dir = './',
    outdir='./'
    wf_collect=.true.
 /
 &system
    ibrav=1
    celldm(1)=${alat}
    nat=216,
    ntyp=1,
    ecutwfc = 30,
    occupations='smearing',
    degauss=0.001
 /
 &electrons
    conv_thr = 1.0e-8
    mixing_beta = 0.5
 /
 &ions
 /
ATOMIC_SPECIES
  Si  28.086  Si.pbe-mt_fhi.UPF
ATOMIC_POSITIONS  crystal
Si     0.000000    0.000000    0.000000
Si     0.000000    0.166667    0.166667
Si     0.166667    0.000000    0.166667
Si     0.166667    0.166667    0.000000
Si     0.250000    0.083333    0.250000
Si     0.083333    0.083333    0.083333
Si     0.083333    0.250000    0.250000
Si     0.250000    0.250000    0.083333
Si     0.333333    0.000000    0.000000
Si     0.333333    0.166667    0.166667
Si     0.500000    0.000000    0.166667
Si     0.500000    0.166667    0.000000
Si     0.583333    0.083333    0.250000
Si     0.416667    0.083333    0.083333
Si     0.416667    0.250000    0.250000
Si     0.583333    0.250000    0.083333
Si     0.666667    0.000000    0.000000
Si     0.666667    0.166667    0.166667
Si     0.833333    0.000000    0.166667
Si     0.833333    0.166667    0.000000
Si     0.916667    0.083333    0.250000
Si     0.750000    0.083333    0.083333
Si     0.750000    0.250000    0.250000
Si     0.916667    0.250000    0.083333
Si     0.000000    0.333333    0.000000
Si     0.000000    0.500000    0.166667
Si     0.166667    0.333333    0.166667
Si     0.166667    0.500000    0.000000
Si     0.250000    0.416667    0.250000
Si     0.083333    0.416667    0.083333
Si     0.083333    0.583333    0.250000
Si     0.250000    0.583333    0.083333
Si     0.333333    0.333333    0.000000
Si     0.333333    0.500000    0.166667
Si     0.500000    0.333333    0.166667
Si     0.500000    0.500000    0.000000
Si     0.583333    0.416667    0.250000
Si     0.416667    0.416667    0.083333
Si     0.416667    0.583333    0.250000
Si     0.583333    0.583333    0.083333
Si     0.666667    0.333333    0.000000
Si     0.666667    0.500000    0.166667
Si     0.833333    0.333333    0.166667
Si     0.833333    0.500000    0.000000
Si     0.916667    0.416667    0.250000
Si     0.750000    0.416667    0.083333
Si     0.750000    0.583333    0.250000
Si     0.916667    0.583333    0.083333
Si     0.000000    0.666667    0.000000
Si     0.000000    0.833333    0.166667
Si     0.166667    0.666667    0.166667
Si     0.166667    0.833333    0.000000
Si     0.250000    0.750000    0.250000
Si     0.083333    0.750000    0.083333
Si     0.083333    0.916667    0.250000
Si     0.250000    0.916667    0.083333
Si     0.333333    0.666667    0.000000
Si     0.333333    0.833333    0.166667
Si     0.500000    0.666667    0.166667
Si     0.500000    0.833333    0.000000
Si     0.583333    0.750000    0.250000
Si     0.416667    0.750000    0.083333
Si     0.416667    0.916667    0.250000
Si     0.583333    0.916667    0.083333
Si     0.666667    0.666667    0.000000
Si     0.666667    0.833333    0.166667
Si     0.833333    0.666667    0.166667
Si     0.833333    0.833333    0.000000
Si     0.916667    0.750000    0.250000
Si     0.750000    0.750000    0.083333
Si     0.750000    0.916667    0.250000
Si     0.916667    0.916667    0.083333
Si     0.000000    0.000000    0.333333
Si     0.000000    0.166667    0.500000
Si     0.166667    0.000000    0.500000
Si     0.166667    0.166667    0.333333
Si     0.250000    0.083333    0.583333
Si     0.083333    0.083333    0.416667
Si     0.083333    0.250000    0.583333
Si     0.250000    0.250000    0.416667
Si     0.333333    0.000000    0.333333
Si     0.333333    0.166667    0.500000
Si     0.500000    0.000000    0.500000
Si     0.500000    0.166667    0.333333
Si     0.583333    0.083333    0.583333
Si     0.416667    0.083333    0.416667
Si     0.416667    0.250000    0.583333
Si     0.583333    0.250000    0.416667
Si     0.666667    0.000000    0.333333
Si     0.666667    0.166667    0.500000
Si     0.833333    0.000000    0.500000
Si     0.833333    0.166667    0.333333
Si     0.916667    0.083333    0.583333
Si     0.750000    0.083333    0.416667
Si     0.750000    0.250000    0.583333
Si     0.916667    0.250000    0.416667
Si     0.000000    0.333333    0.333333
Si     0.000000    0.500000    0.500000
Si     0.166667    0.333333    0.500000
Si     0.166667    0.500000    0.333333
Si     0.250000    0.416667    0.583333
Si     0.083333    0.416667    0.416667
Si     0.083333    0.583333    0.583333
Si     0.250000    0.583333    0.416667
Si     0.333333    0.333333    0.333333
Si     0.333333    0.500000    0.500000
Si     0.500000    0.333333    0.500000
Si     0.500000    0.500000    0.333333
Si     0.583333    0.416667    0.583333
Si     0.416667    0.416667    0.416667
Si     0.416667    0.583333    0.583333
Si     0.583333    0.583333    0.416667
Si     0.666667    0.333333    0.333333
Si     0.666667    0.500000    0.500000
Si     0.833333    0.333333    0.500000
Si     0.833333    0.500000    0.333333
Si     0.916667    0.416667    0.583333
Si     0.750000    0.416667    0.416667
Si     0.750000    0.583333    0.583333
Si     0.916667    0.583333    0.416667
Si     0.000000    0.666667    0.333333
Si     0.000000    0.833333    0.500000
Si     0.166667    0.666667    0.500000
Si     0.166667    0.833333    0.333333
Si     0.250000    0.750000    0.583333
Si     0.083333    0.750000    0.416667
Si     0.083333    0.916667    0.583333
Si     0.250000    0.916667    0.416667
Si     0.333333    0.666667    0.333333
Si     0.333333    0.833333    0.500000
Si     0.500000    0.666667    0.500000
Si     0.500000    0.833333    0.333333
Si     0.583333    0.750000    0.583333
Si     0.416667    0.750000    0.416667
Si     0.416667    0.916667    0.583333
Si     0.583333    0.916667    0.416667
Si     0.666667    0.666667    0.333333
Si     0.666667    0.833333    0.500000
Si     0.833333    0.666667    0.500000
Si     0.833333    0.833333    0.333333
Si     0.916667    0.750000    0.583333
Si     0.750000    0.750000    0.416667
Si     0.750000    0.916667    0.583333
Si     0.916667    0.916667    0.416667
Si     0.000000    0.000000    0.666667
Si     0.000000    0.166667    0.833333
Si     0.166667    0.000000    0.833333
Si     0.166667    0.166667    0.666667
Si     0.250000    0.083333    0.916667
Si     0.083333    0.083333    0.750000
Si     0.083333    0.250000    0.916667
Si     0.250000    0.250000    0.750000
Si     0.333333    0.000000    0.666667
Si     0.333333    0.166667    0.833333
Si     0.500000    0.000000    0.833333
Si     0.500000    0.166667    0.666667
Si     0.583333    0.083333    0.916667
Si     0.416667    0.083333    0.750000
Si     0.416667    0.250000    0.916667
Si     0.583333    0.250000    0.750000
Si     0.666667    0.000000    0.666667
Si     0.666667    0.166667    0.833333
Si     0.833333    0.000000    0.833333
Si     0.833333    0.166667    0.666667
Si     0.916667    0.083333    0.916667
Si     0.750000    0.083333    0.750000
Si     0.750000    0.250000    0.916667
Si     0.916667    0.250000    0.750000
Si     0.000000    0.333333    0.666667
Si     0.000000    0.500000    0.833333
Si     0.166667    0.333333    0.833333
Si     0.166667    0.500000    0.666667
Si     0.250000    0.416667    0.916667
Si     0.083333    0.416667    0.750000
Si     0.083333    0.583333    0.916667
Si     0.250000    0.583333    0.750000
Si     0.333333    0.333333    0.666667
Si     0.333333    0.500000    0.833333
Si     0.500000    0.333333    0.833333
Si     0.500000    0.500000    0.666667
Si     0.583333    0.416667    0.916667
Si     0.416667    0.416667    0.750000
Si     0.416667    0.583333    0.916667
Si     0.583333    0.583333    0.750000
Si     0.666667    0.333333    0.666667
Si     0.666667    0.500000    0.833333
Si     0.833333    0.333333    0.833333
Si     0.833333    0.500000    0.666667
Si     0.916667    0.416667    0.916667
Si     0.750000    0.416667    0.750000
Si     0.750000    0.583333    0.916667
Si     0.916667    0.583333    0.750000
Si     0.000000    0.666667    0.666667
Si     0.000000    0.833333    0.833333
Si     0.166667    0.666667    0.833333
Si     0.166667    0.833333    0.666667
Si     0.250000    0.750000    0.916667
Si     0.083333    0.750000    0.750000
Si     0.083333    0.916667    0.916667
Si     0.250000    0.916667    0.750000
Si     0.333333    0.666667    0.666667
Si     0.333333    0.833333    0.833333
Si     0.500000    0.666667    0.833333
Si     0.500000    0.833333    0.666667
Si     0.583333    0.750000    0.916667
Si     0.416667    0.750000    0.750000
Si     0.416667    0.916667    0.916667
Si     0.583333    0.916667    0.750000
Si     0.666667    0.666667    0.666667
Si     0.666667    0.833333    0.833333
Si     0.833333    0.666667    0.833333
Si     0.833333    0.833333    0.666667
Si     0.916667    0.750000    0.916667
Si     0.750000    0.750000    0.750000
Si     0.750000    0.916667    0.916667
Si     0.916667    0.916667    0.750000
K_POINTS automatic
1 1 1 0 0 0
EOF
srun -n $SLURM_NTASKS --ntasks-per-node=$SLURM_NTASKS_PER_NODE -c $SLURM_CPUS_PER_TASK --cpu_bind=rank --hint=nomultithread  pw.x <pw.in > si.out